Setelah menjadi universitas, Masjid Al-Azhar ditutup pada tahun 1171. Penutupan berlangsung selama 100 tahun setelah Dinasti Ayubbiyah menguasai Mesir.

Masjid Al-Azhar kemudian dibuka kembali oleh Dinasti Mamluk, yang menggantikan Dinasti Ayyubiyah pada 1266. Sultan Al-Zaher Baybar, penguasa Mamluk yang membuka kembali masjid. Selanjutnya, Masjid alami renovasi setelah 300 tahun berdiri, tepatnya 1302.

Sumber: Egypt Today