Rasulullah SAW juga pernah melakukan sholat sembilan rakaat tanpa duduk kecuali pada rakaat delapan. Kemudian, beliau SAW baru mengerjakan rakaat kesembilan. Rasulullah SAW juga pernah shalat tujuh rakaat tan pa duduk kecuali rakaat terakhir. Contoh lainnya, Rasulullah SAW pernah shalat tujuh rakaat tanpa duduk kecuali rakaat keenam.

Selain itu, sholat tiga rakaat berturut-turut tanpa duduk kecuali pada rakaat terakhir. Pada praktik tiga rakaat ini, Rasulullah memiliki komentar khusus, Janganlah kalian mengerjakan sholat witir dengan tiga rakaat, shalatlah lima rakaat, atau tujuh rakaat, dan jangan pula kalian menyerupai shalat witir seperti shalat Maghrib. (HR Ibnu Hibban).

Doa Qunut juga lazim dibaca pada rakaat terakhir sholat witir. Membaca qunut diyakini sebagai hal yang sunah. Rasulullah SAW pernah membaca doa qunut pada sebelum dan sesudah rukuk. Meskipun demikian, al-Qahthani berpendapat, lebih afdhal doa qunut setelah rukuk karena lebih sering disebutkan dalam sejumlah hadis.

Setelah menunaikan sholat penutup ini, Rasulullah pun membaca zikir subhanal malikil quddus yang berarti Mahasuci Raja yang kudus sebanyak tiga kali. Sesudah itu, Beliau SAW pun memanjangkan suaranya saat memasuki bagian akhir. Rabbul Malaikati warruh yang artinya Rabb malaikat dan roh. Wal lahu a'lam